任天堂在FC推出的第三款瑪利歐兄弟系列遊戲，創下史上第二賣座銷售紀錄。第二代金牌瑪利歐出在disk版本，三代內容一樣是橫向過關遊戲，故事仍是碧姬公主被庫巴所綁架，瑪利歐展開營救任務。舞台分成8個王國1：草原之國（草原の国，Grass Land）2：沙漠之國（砂漠の国，Desert Hill）太陽及磚塊會突然攻擊 3：海洋之國（海の国，Ocean Side）需游泳過關。4:巨大之國（巨大の国，Big Island）5：天空之國（空の国，The Sky）6：冰雪之國（氷の国，Iced Land）地上非常濕滑 7：水管之國（土管の国，Pipe Maze）8：黑暗之國（暗黒の国，Castle of Kuppa）9:跳關區:在使用傳送之笛就可以到達。關卡中除一般蘑菇可以變大以外，還增加許多新道具如超級葉子可讓瑪利歐飛上天空，每次過關還可以累積一個道具，若連續有三個同樣道具就可以增加台數。在當時年代，不論是音樂或是畫面都是超級大作。

瑪莉兄弟3的關卡眾多，如果只想在最短時間內全破，可以在初期拿到三支笛子 ，就可以直接跳到第八關。第一根笛子在1-3的空中白色方塊，先踢一下在那移動的紅龜 ，拿起後在那蹲下 ，來到下方後，這時候開始衝刺，甚麼動作都不要做，紅龜就會跟另一隻烏龜對撞，加速前進就能到隱藏笛子的地方。如果擔心敵人過多，可以先到白色方塊後方清理舞台，然後再回頭來到白色方塊的地方操作。第二根笛子在第一關出現的第一個城堡，在進去後的第一個畫面的最後方，會看到一隻骷髏龜，踢碎後用貍貓能力，開始衝刺飛起到上方，就能飛到隱藏的房間拿到笛子。最後一根笛子在地圖畫面上會出現的火鐵槌龜身上，進去關卡擊敗後就能拿到槌子 ，然後到右上方的角落使用槌子就能打碎石頭，出現一條新的道路，地圖上又會出現火鐵槌龜，擊敗後就能拿到最後一根笛子。

另一個的密技是抵達第八關，進入飛船舞台後，鑽到船身下方不斷按A紐游泳前進，游過兩條船後就能看到最後的船尾，然後等船沉到底後再跳上去，就可以直接與小boss對決。須注意如果沒有潛到船身底下就會被持續移動的畫面切過死亡，游泳期間沒有持續按A紐也會下沉死亡。

到了最後關卡 會看到庫巴的城堡 解鎖前會看到前方的坦卡關卡 可以用狸貓的能力 飛到上方的飛船 就可以躲過地面的攻擊 持續操作幾次就能看到小boss的水管

三代的關卡有許多可以增加無限台數的地方 首先在1-2關卡 會出現兩隻蘑菇(Goomba/クリボー)跟一隻飛蘑菇的地方 用狸貓的跳躍能力 不斷連續的部落地踩扁 左邊的水管會持續跑出蘑菇 等達到一定分數後 每踩一次就會增加一台數 第二關的第一個堡壘 進去後會馬上看到三隻骷髏龜 用狸貓的跳躍能力 不斷的不落地踩扁 持續下去後就會持續增加台數 

在3-4關 先將雲龜引道懸在空中的水管地區 然後站在金磚上 丟下烏龜殼 當雲龜持續丟下綠色炸彈時 就會不斷被左右移動的龜殼擊落 時間久了就會不斷增加台數 

在3-9關 將龜殼丟在兩個砲台中間 當飛彈不斷射出 就會碰撞到龜殼後消失 這時候分數會不斷攀升 然後持續增加台數

在4-1關 用狸貓的能力 不斷來回踩踏三隻烏龜 時間久了就開始不斷增加台數