2004年上市的《薩爾達傳說 不可思議的帽子》（ゼルダの伝説 ふしぎのぼうし/The Legend of Zelda: The Minish Cap），是被許多人公認是為GBA平台史上最好的前十大遊戲之一。該遊戲是系列的第12部作品，在歐美發售後，得到的銷售數字及口碑都相當不錯。最多可以儲存三個檔案，故事描述很久很久以前，世界即將被黑暗力量所吞噬，這時手指般大小的皮克爾(Picori)從天而降，帶給勇者金光閃閃的寶劍。集智慧及勇氣於一身的勇者，最終打倒黑暗勢力，而寶劍也被後代小心的放置於神龕內。

這天薩爾達公主又從城堡偷溜出來找林克，身為刀匠的爺爺史密斯(Smith) ，將替海拉魯國王(Hyrule)鑄造完成的劍交給林克，並囑咐與公主在慶祝活動上，要隨時保護好其安全。公主會將贏得的小盾牌送給林克，之後就可以用盾牌來開路前往城堡。這時候會聽到國王解說皮克爾(Picori)寶刀的歷史。之後競賽贏家巫師庫夫(Vaati)出現，獲得碰觸寶刀的機會，沒想到他卻將寶刀弄成碎片，打開寶箱讓許多妖怪都逃出。

庫夫(Vaati)在離開之前，還對薩爾達公主施下魔法，讓她變成石頭。於是國王將碎片將給林克，並贈予祖父鑄造的劍，希望還是小孩的林克，可以看到皮克爾(Picori)，能將寶刀再次修復，並破解施在薩爾達公主身上的魔法。

一開始會有三顆星，每拿四個小血容器就能變成一顆心的容器。打倒敵人或是花草，有時候會出現心、金錢或道具。按手把的R按鈕就能翻滾。按開始紐就能看到選單，按L鍵就能往左移動，按R鍵就能往右移動。選單有:1.物件(ITEMS):可以按A或B紐進行武器及防具，手持位置的更換 2.冒險狀態(QUEST STATUS) 3.地圖(MAP):選擇想要看的區塊，按A紐就能放大，按上下紐移動。按A鈕就能揮劍攻擊，B則可使用道具或是盾牌防守，更改設定可以透過選單進行修改。

當冒險正式開始。移動後地圖的右下方區塊，會碰到類似鴨子型態的艾塞羅(Ezlo)，之前徒弟庫夫搶走他所製作的魔法帽，並對他下了詛咒變成帽子，於是跟林克一起踏上冒險。在艾塞羅的幫助下，林克可以縮小到皮克爾的大小，開始蒐集地、火、水、風的元素，並注入劍內，讓四人之劍的力量再現，準備與庫夫正式決鬥。整體而言，這是一款相當高水準的遊戲，操作及介面都與前作類似，並增添許多趣味，直到現在許多玩家能給予高分評價。